Die Endometriose-Operation gliedert sich in drei Hauptphasen: Vorbereitung, der chirurgische Eingriff und die anschließende Nachsorge. In der Vorbereitungsphase wird nach einer Untersuchung gemeinsam über die Notwendigkeit einer Operation entschieden, ein Termin vereinbart und detailliert über den Ablauf informiert. Der Umfang des Eingriffs richtet sich nach der Lage und Ausdehnung der Endometriose. Am Operationstag ist Nüchternheit erforderlich, und die Patientin wird nach der Narkose operiert. Anschließend erfolgt die Überwachung im Aufwachraum und später die Verlegung auf die Normalstation. In der Nachsorgephase erläutert der Chirurg den durchgeführten Eingriff, zeigt bei Bedarf Bilder oder Videos, und tägliche Visiten finden statt. Nach der Entlassung wird ein Folgetermin nach etwa zwei bis drei Wochen vereinbart, um die Befunde und Ergebnisse zu besprechen und über eventuell notwendige weitere Therapien zu entscheiden.