L'opération pour l'endométriose n'est pas une solution systématique. Elle est envisagée lorsque les traitements hormonaux ne soulagent plus les douleurs quotidiennes de la patiente. La chirurgie devient également une option sérieuse si l'endométriose affecte d'autres organes, tels que la vessie ou les intestins, afin de préserver leur fonctionnement. C'est aussi une possibilité en cas d'infertilité, car elle peut aider à libérer des adhérences et améliorer les chances de grossesse. La décision d'opérer doit être prise en collaboration avec une équipe multidisciplinaire. L'objectif principal est de permettre à la personne de retrouver une qualité de vie normale ou de concrétiser ses projets personnels, y compris le désir de maternité.