Endometriose kann die Fruchtbarkeit beeinträchtigen, wobei die Ausprägung der Einschränkung von der Ausdehnung der Erkrankung und den betroffenen Organen wie Eierstöcken, Eileitern und Gebärmutter abhängt. Verklebungen der Eileiter können den Weg für Spermien blockieren und die Befruchtung verhindern. Endometriome, auch als Schokoladenzysten bekannt, können an den Eierstöcken entstehen, deren Hormonfunktion beeinträchtigen und somit die Fähigkeit zur Empfängnis mindern. Zudem können immunologische Faktoren, verursacht durch chronische Entzündungen in den Fortpflanzungsorganen, das Milieu für Eizellen und Spermien ungünstig machen. Betroffenen Frauen, die Schwierigkeiten haben schwanger zu werden, wird empfohlen, frühzeitig ein Kinderwunschzentrum aufzusuchen. Dort können alle Aspekte der Fertilitätseinschränkung umfassend geprüft und individuelle Möglichkeiten zur Unterstützung der Schwangerschaftsplanung aufgezeigt werden, auch unter Berücksichtigung des männlichen Partners. Eine frühzeitige Information ist wichtig für die Familienplanung.