Endometriose kann neben Schmerzen auch die Fruchtbarkeit beeinträchtigen. Das Ausmaß der Einschränkung hängt davon ab, wie weit die Erkrankung verbreitet ist und welche Organe wie Eierstöcke, Eileiter oder die Gebärmutter betroffen sind. Verwachsungen können Eileiter blockieren und die Befruchtung verhindern. Zysten an den Eierstöcken, sogenannte Endometriome, können Vernarbungen verursachen und die Hormonfunktion stören. Zudem können immunologische Faktoren eine Rolle spielen, indem sie ein Umfeld schaffen, das die Befruchtung erschwert. Frauen mit Endometriose, die Schwierigkeiten haben, schwanger zu werden, wird empfohlen, frühzeitig ein Kinderwunschzentrum aufzusuchen. Dort werden die Ursachen der eingeschränkten Fruchtbarkeit umfassend untersucht, auch mögliche Einschränkungen beim Partner. Basierend auf den Befunden werden dann individuelle Möglichkeiten zur Unterstützung der Schwangerschaft besprochen und frühzeitige Information als wichtig für die Familienplanung betont.